Diversidad genética con el gen aroE en Streptococcus mutans

Abstract

El objetivo de este estudio fue caracterizar la diversidad genética de cepas de la Provincia de Córdoba (Argentina). Se obtuvieron 39 cepas recuperadas de saliva de niños de cuatro escuelas urbano-marginales. Luego de extraer el ADN, se amplificó y secuenció el gen aroE. Las secuencias fueron alineadas y comparadas con las disponibles en GenBank provenientes de Japón (n=89), Tailandia (n=52) y Finlandia (n=12) para evaluar si algunos alelos se compartían entre países. Se calculó la diversidad alélica y nucleotídica promedio y la distancia genética de Kimura 2 parámetros (K2P). La diferenciación genética entre los diferentes países fue estimada con comparaciones de F A partir de las 192 cepas analizadas, se detectaron 30 alelos. Tres estaban presentes en los cuatro países, cinco se compartieron entre tres países y tres entre dos países. Argentina presentó 6 alelos exclusivos, Tailandia 3, Japón 10 y Finlandia ninguno. La diversidad alélica fue alta (0.804), pero la diversidad nucleotídica fue baja (0.0042); la distancia genética promedio K2P fue de 0.87%. Las comparaciones de F ST revelaron baja diferenciación entre Argentina, Tailandia y Japón, mientras que Finlandia fue el más divergente En las cepas analizadas se detectó una alta diversidad alélica con bajos niveles de diferenciación genética. Cuatro cepas detectadas en Argentina tienen distribución mundial, lo cual produciría niveles de diferenciación genética bajos entre países. La distribución restringida de otros alelos reflejaría diferencias epidemiológicas en la transmisión