Integración de datos de expresión génica asociados a líneas celulares de cánceres: un enfoque utilizando la metodología STATIS-ACT, métodos biplot y minería de textos

Abstract

Los datos económicos, donde se analiza la expresión de miles de genes, proteínas, metabolitos en distintas muestras biológicas, comprenden una gran cantidad de áreas de aplicación y su estudio ha crecido de manera exponencial en los últimos a~nos. La integración de datos es uno de los principales objetivos actuales en bio-ciencias, dado que es común medir expresión simultánea de genes, proteínas y metabolitos o bien tener mediciones de la expresión genética de las mismas muestras en diferentes plataformas de análisis, generando, por lo tanto, distintas fuentes de información. La integración implica el meta-análisis de sus resultados o el análisis simultáneos de los datos originales. En el marco de este trabajo, se realiza una propuesta metodológica para abordar el problema de estudio y comparación de datos genéticos provenientes de distintas plataformas de microarreglos y el problema de selección de genes basada en los métodos estadísticos de k-tablas y Biplot. Se realiza una aplicación de la metodología propuesta a datos de expresión genética de 60 líneas celulares de 9 tipos diferentes de cáncer provenientes de cuatro plataformas de análisis del panel NCI-60.