| dc.description.abstract | os Aichivirus (AiV) pertenecen a la familia Picornaviridae, género Kobuvirus. Al presente se han descripto 3 genotipos de AiV-humano: A, B y C. Estos virus son transmitidos por vía fecal-oral, y se los considera agentes emergentes de gastroenteritis aguda (GEA). El objetivo de este trabajo de especialidad fue estudiar la presencia AiV y caracterizar el genoma viral en muestras de aguas residuales crudas como reflejo de la circulación viral en la población y en niños con GEA en la ciudad de Córdoba, Argentina. Se analizaron muestras de aguas residuales (AR) (n= 59) obtenidas del conducto de la red central que ingresa a la planta depuradora de la ciudad de Córdoba (período: 2012-2013, 2015, 2018-2019) y muestras de materia fecal (MF) de niños con GEA (n=155), asistidos en la Clínica Universitaria Reina Fabiola de la ciudad de Córdoba, obtenidas en los años 2013 (n= 13), 2014 (n=18), 2015 (n=15), 2016 (n=1), 2017 (n=1), 2018 (n=18) y 2019 (n=53). Materiales y Métodos: Se realizó una concentración viral en AR a través de la técnica de elusión y precipitación con PEG-6000, seguido de la detección molecular de AiV para los concentrados virales y muestras de materia fecal. Para esto, se llevó a cabo una extracción genómica automatizada utilizando el sistema MagNA Pure 96 DNA y RNA para muestras de aguas residuales, y para muestras de materia fecal la extracción del genoma se realizó a partir del kit comercial ROCHE-LS High Pure Viral Nucleic Acid. Posteriormente, se realizó la técnica de RT-PCR: PCR anidada con primers dirigidos hacia una región conservada del genoma viral, región de unión al ribosoma 3CD, de 266 pb. Se seleccionaron muestras positivas para realizar la secuenciación y posterior análisis filogenético. En AR se detectó la presencia de AiV en todo el período estudiado (frecuencia global de detección: 61%) sin patrón estacional. La frecuencia global de detección del genoma de AiV en niños con GEA fue del 14,8% (23/155). AiV se encontró en monodetección (sin la presencia de RV y/o AdV) en el 10,3% de las mismas (11/107) y en co-infección con rotavirus y adenovirus en el 10,4% (11/107) y 1% (1/107) respectivamente. No se observó diferencias significativas en la frecuencia de detección de AiV entre niños internados y ambulatorios. Según la variable género y grupo etario, AiV se detectó con mayor frecuencia en varones y en el grupo de niños menores de cinco años de edad. Quince amplicones (8 MF y 7 de AR) fueron seleccionados para secuenciación y análisis filogenético. Si bien la identidad nucleotídica entre las cepas detectadas en aguas residuales y en muestras de niños con diarrea en la ciudad de Córdoba muestran una alta identidad nucleotídica (93.6% al 99.2%), en el árbol filogenético muestran la existencia de variaciones intragenotípicas que se reflejan en diferentes linajes en el árbol filogenético. Teniendo en cuenta que la región analizada pertenece a codificación genética viral para proteínas no estructurales (región de unión al ribosoma 3CD), esta variación intragenotípica no indica cambios antigénicos en el virus. Los resultados obtenidos muestran que AiV se detectó en el 14,83% de las muestras analizadas y que la suma de AiV al diagnóstico de RV y AdV (agentes virales más frecuentes de diarrea en niños menores de 5 años) aumenta significativamente el porcentaje de pacientes con diagnóstico viral en niños con diarrea. En este trabajo, los once pacientes infectados con AiV, en ausencia de detección de RV y/ o AdV presentaron síntomas de gastroenteritis, especialmente diarrea, fiebre y vómitos, todos estos, síntomas compatibles con los descriptos en la bibliografía por la infección por AiV. Las altas tasas de detección de AiV en aguas residuales y la detección de AiV en casos de diarreas, mayoritariamente en niños menores de 5 años, sugeriría que el virus circularía de manera endémica en la población de la ciudad de Córdoba y que la infección por AiV se adquiriría temprano en la vida. La detección del genotipo B con alta identidad nucleotídica entre cepas presentes en aguas residuales crudas y materia fecal de niños con diarrea, permite sugerir que las aguas residuales y toda matriz contaminada con aguas crudas (aguas superficiales, aguas de riego contaminadas y vegetales relacionados al riego con estas aguas) sería un eslabón en la cadena de transmisión de AiV a población expuesta. Estos primeros datos obtenidos desafían a abordar estudios de mayor envergadura respecto a la presencia de AiV en niños con diarrea, de seroprevalencia de AiV en población de distintos grupos etarios y en la continuidad del estudio de aguas residuales para reportar sobre la circulación viral y características moleculares de cepas virales que circulan en la población. | es |
